Την παραίτησή του υπεβάλλε ο υπουργός εξωτερικών Νίκος Κοτζιάς. Ο κ. Κοτζιάς υπέβαλε την παραίτησή του γιατί θεωρεί ότι δεν τον κάλυψε ο πρωθυπουργός στις κατηγορίες του υπουργού εθνικής άμυνας Πάνου Καμμένου για κακοδιαχείρισης των μυστικών κονδυλίων του υπουργείου Εξωτερικών. Ο κ. Κοτζιάς φαίνεται ότι άφησε αιχμές κατά του πρωθυπουργού Αλέξη Τσίπρα λέγοντας ότι στήριξε τον λαϊκιστή υπουργό του. Η παραίτηση έγινε δεχτή από τον πρωθυπουργό, ενώ σε ανακοίνωση του γραφείου Τύπου του πρωθυπουργού τονίζεται:
Ο Πρωθυπουργός, Αλέξης Τσίπρας, έκανε δεκτή την παραίτηση του Υπουργού Εξωτερικών, Νίκου Κοτζιά.
Τον ευχαρίστησε θερμά για την προσφορά του στην κυβέρνηση και τη χώρα τα τελευταία 3,5 χρόνια.
Το Υπουργείο Εξωτερικών αναλαμβάνει ο Πρωθυπουργός προκειμένου να συνδράμει με όλες του τις δυνάμεις στην επιτυχή ολοκλήρωση της Συμφωνίας των Πρεσπών.